高速公路上违法停车会受到不同的处罚，具体扣分如下：
1. 驾驶非营运客车在行车道上停车，罚款200元、扣6分。
2. 非紧急情况下在应急车道上停车，罚款200元、扣6分。
3. 驾驶营运客车在行车道上停车，罚款200元、扣12分。
4. 非紧急情况下在应急车道上停车，罚款200元、扣12分。
5. 在道路上发生故障或事故停车后，未按规定使用灯光和设置警告标志的，罚款200元、扣3分。如果处罚加倍，则扣12分。

高速公路上违法停车的扣分情况视具体情况而定。如果是故障车辆未移至应急车道但能够移动，将被罚款200元，并扣6分。营运客车一次违停将扣除12分。

在高速公路违法停车会扣6分或者12分。具体规定如下：驾驶人驾驶营运客车在高速公路车道内停车，一次记12分；驾驶人驾驶非营运客车在高速公路车道内停车，一次记6分。同时，违法停车还会被罚款二十元以上二百元以下。