违法占用应急车道行驶的扣分根据具体情况而定。如果是驾驶非营运客车的机动车在高速公路车道内停车，每次会被扣6分。而如果驾驶机动车在高速公路或城市快速路上违法占用应急车道行驶，一次也会被扣6分。此外，驾驶机动车在遇到前方机动车停车或缓慢行驶时，借道超车、占用对面车道或穿插等候车辆的话，一次会被扣2分。值得注意的是，驾驶运营客车在应急车道违法停车会被记12分。

在高速公路或城市快速路上，违法占用应急车道行驶一次会被扣6分。这是根据《道路交通安全违法行为记分分值》规定的。应急车道指的是与右侧行车道相邻的地方，宽度超过3米，有效长度大于等于30米，适合机动车停靠的部分，包括硬路肩。相关法律条例是《中华人民共和国道路交通安全法实施条例》第八十二条，禁止机动车在高速公路上进行以下行为：倒车、逆行、越过中央分界线或在车道上停车；在匝道、加速车道或减速车道上超车；在非紧急情况下行驶或停车在应急车道上；以及试驾或学习驾驶机动车辆。以上内容可供参考，详细信息可以查看《道路交通安全违法行为记分管理办法》第十条。

违法占用应急车道行驶扣几分？根据我国相关法律规定，如果驾驶机动车在高速公路或城市快速路上违法占用应急车道行驶，一次记6分。此外，还有其他行为也会被扣分，比如驾驶营运客车以外的机动车在高速公路车道内停车，一次记6分。另外，如果在紧急情况下需要在高速应急车道上临时停车，记得确保车辆停在应急车道白线内，并尽量靠近护栏、远离行车道，同时开启双闪灯并放置三角警示牌。如果没有做到这些，交警可能会处罚驾驶员3分并罚款200元。